AlphaFold - प्रोटीन फोल्डिंग समस्या का समाधान

 (deepmind.com)
9 पॉइंट द्वारा sduck4 2020-12-01 | 2 टिप्पणियां | WhatsApp पर शेयर करें
  • DeepMind द्वारा विकसित एक neural network मॉडल, जो प्रोटीन फोल्डिंग समस्या को हल करता है

प्रोटीन फोल्डिंग समस्या

  • प्रोटीन अमीनो एसिड की चेन के रूप में जुड़े होते हैं और 3D में मुड़ी हुई जटिल संरचना बनाते हैं

  • प्रोटीन को बनाने वाले अमीनो एसिड और उनकी folded संरचना के अनुसार वे कई तरह के कार्य करते हैं

  • लेकिन केवल अमीनो एसिड के क्रम के आधार पर प्रोटीन की संरचना का अनुमान लगाना बहुत कठिन है

AlphaFold

  • Protein Data Bank के लगभग 170,000 प्रोटीन संरचना डेटा और इसके अलावा जिन प्रोटीनों की संरचना ज्ञात नहीं है, ऐसे डेटा पर training की गई

  • लगभग 128 TPUv3 cores का उपयोग करके कई हफ्तों तक training की गई

CASP(Critical Assessment of protein Structure Prediction)

  • 1994 में पहली बार आयोजित, हर 2 साल में होने वाली विश्व स्तरीय प्रोटीन संरचना prediction प्रतियोगिता

  • उन प्रोटीनों की संरचना का अनुमान लगाया जाता है जिनकी संरचना अभी ज्ञात नहीं है

  • AlphaFold का शुरुआती version 2018 में आयोजित CASP13 में शामिल हुआ था

  • 2020 में आयोजित CASP14 में AlphaFold ने औसत 92.4 GDT के साथ पहला स्थान प्राप्त किया

  • यह लगभग एक परमाणु की चौड़ाई जितनी त्रुटि के बराबर है

अपेक्षित प्रभाव और भविष्य की दिशा

  • इस वर्ष AlphaFold ने ORF3a, ORF8 जैसे coronavirus प्रोटीनों का prediction किया

  • उम्मीद है कि आगे चलकर यह विभिन्न जैविक समस्याओं के समाधान और नई दवाओं के विकास में योगदान देगा

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2 टिप्पणियां

 
ffdd270 2020-12-01

लगता है अब सेहत का अच्छे से ख़याल रखना पड़ेगा। जब तक जीवन बढ़ाने का सपना सच नहीं हो जाता... इस जीवन में मैं बहुत कुछ करना चाहता/चाहती हूँ ;m;
 
xguru 2020-12-01

सेल की aging को पलटने में protein का इस्तेमाल करने वाला एक लेख आया था।

लगता है AI जीवन-आयु बढ़ाने के सपने को साकार करने में बड़ी भूमिका निभा सकता है।

बूढ़ी त्वचा कोशिकाओं को फिर से युवा बनाने वाली 'सेल रिवर्स-aging' तकनीक सामने आई

http://m.dongascience.donga.com/news.php?idx=41855

सेल aging को पलटने की रणनीतियों में 'रीप्रोग्रामिंग' तकनीक पर सबसे व्यापक रूप से शोध हो रहा है। रीप्रोग्रामिंग वह तकनीक है जिसमें त्वचा कोशिकाओं जैसे किसी विशिष्ट शारीरिक ऊतक में विकसित हो चुकी कोशिकाओं में 'Yamanaka transcription factors' नामक 4 प्रकार के protein जोड़े जाते हैं, ताकि उन्हें किसी specific cell में differentiate होने से पहले की युवा अवस्था में वापस लौटाया जा सके।